Cарариман Фудзикидо Кендзи становится жертвой конфликта ниндзя в Обалдетьвысокомздании Маруноути, где теряет жену и ребёнка и сам оказывается смертельно ранен. Однако в этот момент в него вселяется неопознанная ниндзя-душа, "Нараку-Ниндзя", и Фудзикидо перерождается в убийцу ниндзя - "Ниндзя Слеера".Наконец, в потрясающем сражении ему удаётся уничтожить Синдикат Соукай. Но когда он уже считал свою цель достигнутой, появляется новая ниндзя-организация, Теневая Гильдия Зайбацу, и в ходе крупномасштабного теракта предаёт Нео-Сайтаму огню. Более того, обнаруживается, что Зайбацу причастна к тому самому конфликту, в котором были убиты его жена и ребёнок.А значит, пощады не будет, ведь ниндзя должны умереть! Ниндзя Слеер, Фудзикидо Кендзи направляется в Киото, чтобы разделаться с Зайбацу.