После событий Corpse Party: Blood Covered выжившие пытаются смириться с травматическим инцидентом, произошедшим в начальной школе Тенджин. Хотя проклятие было снято, они потеряли многих друзей, о которых впоследствии все забыли; все, кто погиб в адском измерении, были вычеркнуты из жизни. Однако не все были забыты, и именно этот маленький лучик надежды заставляет двух выживших отправиться в дом убийцы и выяснить происхождение проклятия. Здесь они находят печально известную Книгу Теней - зловещий фолиант, содержащий множество тёмных проклятий и, как ни странно, даже заклинание для воскрешения мёртвых. Не имея другого выхода, они проводят ритуал, но в итоге получают гораздо больше, чем ожидали. Corpse Party: Book of Shadows следует за этими двумя выжившими, искушая судьбу в очередной раз, а также рассказывает о переплетении историй других персонажей серии.