История рассказывает о многовековой войне двух рас живых роботов с планеты Кибертрон. Противостояние автоботов и десептиконов сосредоточино вокруг попыток завладеть как можно большим количеством мини-конов – крошечных ботов, способных в разы усилить и улучшить своих более крупных партнёров. Всё начинается с распространения сообщений о тайной группировке, нападающей на деревни мини-конов и захватывающей их в рабство. Сообщения правдивы, поскольку десептиконы, наделённые мини-конами, атакуют и сокрушают автоботов. Вскоре большинство мини-конов бегут с планеты, но порабощённой десептиконами группы достаточно, чтобы позволить злодеям править в течение целого миллиона лет. Однако когда приходит известие об обнаружении местонахождения остальных мини-конов, обе фракции направляются в новый мир: планету Земля.